Mirando el alert aparentemente no se veía nada, había espacio en los filesystem y el proceso no continuaba... Cancele el proceso e intente parar directamente con un shutdown immediate quedandose el proceso de nuevo enganchado, a este punto y sin ver nada (SAP estaba parado, los filesystem tenian espacio, ...) solo quedaba ver si había sesiones inactivas enganchadas o ya tirar por la calle de en medio y hacer el shutdown abort (cosa que no mola).
Para poder ver estas conexiones inactivas, existe una forma:
ps -ef |grep SID | grep LOCAL=NO
Los procesos que nos aparezcan, los podremos matar con un kill -9. Al matarlos veremos como el shutdown immediate vuelve otra vez a trabajar parando la base de datos ordenadamente.